Зоологический музей Зоологического института Российской Академии Наук (РАН) — старейший зоологический музей на территории России. Зоологический музей Зоологического института РАН был основан в 1832 году на базе зоологических коллекций Натурального кабинета Кунсткамеры.
История коллекций Зоологического музея восходит к истории первого отечественного музея — Кунсткамеры, основанного в 1714 году. Из Москвы были перевезены естественноисторические коллекции, приобретённые Петром I во время его путешествия в Голландию в 1698 году, хранившиеся при Аптекарском приказе. Первоначально они были размещены в Зелёной гостиной Летнего дворца. В 1716 году были приобретены коллекции А. Себы и Х. Готвальда, в 1717 году — Ф. Рюйша.
Эти коллекции содержали большое количество материалов по зоологии. Некоторые из них сохранились в Зоологическом музее и институте до настоящего времени. Помимо покупок, Пётр I уделял большое внимание собиранию коллекций в Российской Империи. Им был издан ряд указов, обязывавших местные власти доставлять в столицу различные произведения природы своего края.
Вскоре для размещения Музея был избран поступивший в казну дом опального боярина А.В. Кикина — "Кикины палаты". В это здание, расположенное на левом берегу Невы неподалёку от Смольного (и в несколько изменённом виде сохранившееся поныне), перевезли коллекции и библиотеку.
В 1719 году Музей в Кикиных палатах стал доступен всем желающим. К 1725 году, по отзывам современников, он уже не уступал лучшим западноевропейским собраниям. По приказу Петра I от марта 1724 года было начато составление альбомов с рисунками наиболее замечательных экспонатов.
В 1724 году был утверждён проект создания в России Академии наук. Кунсткамеру с библиотекой было намечено передать Академии. Для её размещения был отведен участок на Васильевском острове. В распоряжение Академии был передан недостроенный дворец царицы Прасковьи (строительство которого было завершено лишь в 1734 году).
Зоологические коллекции Кунсткамеры в 1767 году были выделены в отдельное подразделение в рамках Кунсткамеры под управление Петра Симона Палласа — одного из знаменитейших ученых-энциклопедистов XVIII века, много сделавшего для описания фауны России.
Постепенно зоологическое собрание всё больше и больше обособлялось в составе Кунсткамеры. В регламенте Академии наук 1803 года зоологическая коллекция упомянута в составе "музея ботаники, зоологии и минералогии". Наступивший в конце XVIII века период войн, охвативший и первую треть следующего столетия, тяжело отразился на пополнении и сохранении коллекций Музея.
В начале 1830-х годов, в ходе реформы Академии наук, коллекции Кунсткамеры разделили на независимые профильные музеи. На основе зоологической коллекций Кунсткамеры возник Зоологический музей, разместившийся в Музейном флигеле Академии, построенном в 1826–1831 годах по проекту архитектора И. Ф. Лукини позади Главного здания Императорской Академии наук на Университетской набережной, дом № 5.
Датой основания Зоологического музея считается 4 июля 1832 года, когда его директор Ф. Ф. Брандт продемонстрировал Физико-математическому отделению Академии наук экспозицию первых трех залов, составленную из уцелевших экспонатов Кунсткамеры. Большая часть выставочных коллекций Кунсткамеры к этому времени была испорчена и не годилась для новой экспозиции. Хорошо сохранились лишь остеологические материалы, спиртовые препараты, коллекции раковин и кораллов, которые и легли в основу создаваемого Зоологического музея.
Вскоре после выделения из состава Кунсткамеры, Музей стал пополняться коллекциями, поступавшими от различных экспедиций, а также путем покупки, обмена с другими учреждениями и приема пожертвований от отдельных лиц.
В середине XIX века собрание Зоологического музея не уступало лучшим коллекциям зарубежных музеев, а в отношении фауны Палеарктики значительно превосходило их. Если в 1832 году все коллекции размещались всего лишь в трех залах, то к 50-летнему юбилею Музея в 1882 году они занимали 32 зала, в которых было выставлено свыше 40 тысяч экспонатов, не считая фондов. Объем коллекций за полстолетия вырос примерно в 20 раз.
Конец XIX — начало XX столетия ознаменовалось активным изучением Центральной Азии. Наиболее крупными и ценными зоологическими сборами этого периода являются коллекции Н. М. Пржевальского, М. В. Певцова, В. И. Роборовского, братьев Г. Е. и М. Е. Грум-Гржимайло, Г. Н. Потанина и П. К. Козлова. Материалы, поступившие уже из первых экспедиций Пржевальского, сделали необходимым расширение площади Музея.
В 1891-1893 годах Музей получил здание на Стрелке Васильевского острова на Университетской набережной, дом № 1, где был открыт для посетителей в 1901 году. Его коллекция была разделена на фондовую и выставочную части. Экспозиция в новом здании состояла из трех разделов. Была вводная часть, посвященная общим явлениям жизни, большая систематическая коллекция и так называемые "биогруппы", в которых некоторые виды животных были показаны в природной обстановке.
Зоологический музей, представлявший собой в этот период не только хранилище коллекций животных, но и научно-исследовательское учреждение, в 1931 году, в ходе реформы Академии наук, был переименован в Зоологический институт. С этого времени Музеем стали называть только выставочную коллекцию института, не утратившую и поныне связь с богатейшей фондовой коллекцией.
Музей и после 1930 года продолжал тесную связь с Зоологическим институтом, пополняя свою экспозицию материалами экспедиций сотрудников института. В 1930-е годы экспозиция Музея претерпела серьёзные изменения. Во время Великой Отечественной войны экспозиция музея оставалась на своём месте, и, в целом, серьёзно не пострадала, хотя здание несколько раз подвергалось обстрелам, в нём не было света и отопления.
В послевоенное время Музеем заведовали В. Б. Дубинин (1947–1954), А. И. Иванов (1954–1961), Д. В. Наумов (1961–1984), Р. Л. Потапов (1985–2006). В настоящее время музеем заведует А. Н. Тихонов.
Современная музейная экспозиция занимает большую часть второго этажа обширного здания Зоологического института, а также хоры в первом зале. Общее число выставленных экспонатов превышает 30 тысяч, а общая площадь экспозиции составляет 6 тысяч м2.
